גוף נפש
פרויד ניסח עוד בימיה הראשונים של הפסיכואנליזה את מודל הדחף, לפיו אנרגיה מניעה בו בעת תופעות גופניות ונפשיות וכל המשמעויות הנפשיות שלא עוברות את הצנזורה הפנימית, עוברות המרה לביולוגיה. כלומר, קונפליקט "לא מודע" (שעוד לא עבר עיבוד מספק באזור "המודע") מקבל ביטוי גופני, כך בעצם הגוף הופך להיות ייצוג של דבר מודחק שאינו יכול להיאמר.
בהרבה מקרים מטופלים מגיעים לנטורופתיה במטרה לחיפוש אחר מזור, לאחר שלא נמצא הסבר רפואי למכאובם הפיזי או לבעיותיהם הבריאותיות. הנטורופתיה רואה את האדם כמכלול שלם המורכב מגוף, נפש ומציאות חיים המשפיעים אחד על השני באופן דינאמי.
ברוב המקרים כאשר פותרים את הקונפליקט הראשוני הרגשי לצד תמיכה בהיבטים הנוספים, ניתן להשיג הטבה משמעותית ולהפחית את העוצמה וההישנות של התסמינים והמחלות.
עם זאת חשוב לציין כי נטורופתיה מוגדרת כרפואה משלימה ומתקיימת לצד הרפואה הקונבנציונלית ואינה באה להחליפה.